时间线
落雨枫线（前传隐藏线）
落雨枫是异世界百科（故事中）的站长，他发现了异世界百科中出现的页面乱码，走访这些页面的作者后察觉到了异常，并且他推理出这些异常与大财阀盘古鹰有关。他参与了黑客组织Wild Wind攻击盘古鹰的行动，找到了一些隐藏资料，但是Wild Wind被盘古鹰找到了源头，成员也逐个被暗杀。于是落雨枫将异世界百科的服务器密钥交给了古川圭介。几天后，落雨枫死于伪装成车祸事故的暗杀，他的想要拯救异世界百科和作者们的愿望，让异世界百科的守护神（看板娘）井伊世界出现在了现实世界中，也让他的灵魂进入了异世界。
上栗田线
实例化后的井伊世界找到了异世界百科上的活跃作者上栗田，并且邀请他成为拯救异世界的战士。随后，上栗田穿梭于各个异世界之间，消除代表着破坏、和页面乱码与作者们的异常都有关联的黑雾。最终，为了抢在魔王破坏更多的异世界之前修复被损坏的异世界，他进入存放着创世魔法书的异世界图书馆，但是没有切断自己与异世界之间的联系，灵魂被撕裂，落入了异世界。
热海赤真线
井伊世界找到了古川圭介（和另外两个作者），作为新的异界战士。几个人的愿望又召唤出了第二个守护神——花藤兰陵，花藤兰陵指定热海赤真成为她的契约者。随后，热海赤真又受到井伊世界的邀请，与另外几个作者会合，确立了“曙光护卫团”这个社团名称，他们开始解决异世界被黑雾侵蚀的问题。
六岗隆线
在网络反抗军和曙光护卫团激活AnoWorld的备用管理AI辉夜后，辉夜开始清除AnoWorld中的模因病毒载体。但是在运行一段时间后，辉夜感觉到了AnoWorld的用户期望逃避到异世界，借助这些企盼的力量，辉夜将某一天在线的大量用户的灵魂转移到了异世界。而在现实世界中，出现了一百多位AnoWorld用户成为植物人的事件，随后又爆出行贿的事情，盘古鹰因此受到处罚，并且股价大跌，不得不出售AnoWorld和相户伊雷萨，梦网计划也停止了。两个月后，曙光护卫团在查出事件和辉夜有关联后，对辉夜进行话聊未果，和辉夜开战，最终两败俱伤，辉夜失去了大部分能力，曙光护卫团团员也落入了各个异世界。
如月苍太线
大财团盘古鹰因为向议员行贿被曝光而受到制裁，被迫将虚拟现实业务出售给了野火，而在这次事件背后，为曙光护卫团打开AnoWorld后门的管理AI辉夜却出现了“现实世界威胁到了人们的梦”的认知，于是她推动了东京神隐事件，将许多拥有前往异世界的强烈愿望的人送入异世界。如月苍太为了拯救面临废弃的超自然研究部，开始调查神隐事件，却被卷入其中，进入了异世界。